Cửa vịnh Maputo quay về hướng đông bắc. Phía đông của vịnh Maputo là bán đảo Machangulo và đảo Inhaca, ngăn cách vịnh với Ấn Độ Dương. Sông Komati đổ ra phía bắc của vịnh Maputo. Cả ba con sông: Matola ở phía bắc, Mbuluzi ở phía tây và Tembe ở phía nam, đều đổ ra cửa sông Estuário do Espírito Santo ở phía tây của vịnh. Thủ đô Maputo của Mozambique nằm ở phía bắc của Espírito Santo, và cây cầu Maputo–Katembe bắc qua cửa sông này.